Το πεντάκτινο αστέρι σημαίνει το North Star, ένα φάρο για ταξιδιώτες στην Αρκτική. Τα λευκά και κίτρινα χρώματα, τα οποία είναι γνωστά ως «μέταλλα» στην εραλδική, λέγεται ανεπίσημα ότι αντιπροσωπεύουν το χιόνι και την ανατολή, αντίστοιχα. Οι δύο λωρίδες διαχωρίζονται από ένα inuksuk, ένα ανθρωποειδές σχήμα που αποτελείται από στοιβαγμένους βράχους. Το inuksuk είναι ένας παραδοσιακός δείκτης ορατός από μεγάλες αποστάσεις στην περιοχή, όπου υπάρχουν λίγα δέντρα ή άλλα ορόσημα. Αρκετοί τοπικοί οργανισμοί έχουν σχεδιάσει κονκάρδες και άλλα σύμβολα που ενσωματώνουν το inuksuit (τον πληθυντικό του inuksuk) σε διάφορα χρώματα.
Το Nunavut είναι η παραδοσιακή πατρίδα των ανθρώπων Inuit, που αποτελούν την πλειοψηφία του τοπικού πληθυσμού. Για δεκαετίες, ο Inuit είχε επιδιώξει να επιτύχει αυτοδιοίκηση στον Καναδά και καλλιτέχνες και ηγέτες της κοινότητας ανέπτυξαν από κοινού τη σημαία και το οικόσημο της νέας επικράτειας με τη βοήθεια της καναδικής εραλδικής αρχής. Συγκεκριμένα, η Meeka Kilabuk της Επιτροπής Εφαρμογής Nunavut και ο Robert Watt, ο αρχηγός του Καναδά, εργάστηκαν για να εκφράσουν τον αυθεντικό συμβολισμό Inuit σε μια μορφή αποδεκτή από τα δόγματα της εραλδίας. Η βασίλισσα Ελισάβετ Β της Βρετανίας ενέκρινε τα δύο σχέδια. Η καναδική επικράτεια της Nunavut δημιουργήθηκε την 1η Απριλίου 1999, και εκείνη την ημέρα η σημαία ανέβηκε για πρώτη φορά.
